اثر القرار الجمهورى الذى اصدره الرئيس مرسى بتعيين اللواء محمد رأفت شحاته رئيسا لجهاز المخابرات العامة حضر رئيس المخابرات الجديد الى قصر الاتحادية وقام بأداء القسم واليمين الدستورية امام الرئيس مرسى وقد اثار هذا القسم الكثير من الجدل من نشطاء سياسيين وكتاب حيث انتقدوا قسم رئيس الجهاز الجديد بالولاء لرئيس الدولة وليس لمصر وكثرت الانتقادات والهجوم على مواقع التواصل الاجتماعى على ذلك
ومن جانبه وردا منه على هذا الموضوع غرد المتحدث الرسمة دكتور ياسر على بأن قسم رئيس المخابرات مختلف عن باقى قسم قيادات الدولة وان هذا متبع منذ عام 1972 منذ عهد السادات كما قام بنشر نص كتابى للقسم شاهد الصورة والفيديو
